Cómo transformar células vivas en ordenadores

Sistemas genéticos realizan operaciones lógicas almacenando datos en el ADN.

Expertos en biología sintética han creado módulos de ADN que realizan operaciones lógicas en células vivas. Estos “circuitos genéticos” podrían utilizarse para registrar momentos clave en la vida de una célula o, activando un interruptor químico, modificar el destino de una célula, anuncian los investigadores. Los resultados se publican esta semana en Nature Biotechnology.

La biología sintética trata de incorporar principios de la ingeniería electrónica en una célula biológica, considerando las funciones de los genes como componentes de un circuito. Con este objetivo, investigadores del Massachusetts Institute of Technology (MIT) en Cambridge, han diseñado un sencillo grupo de módulos genéticos que responden a señales de una forma muy parecida a como la hacen los operadores lógicos booleanos usados en los ordenadores.

DNA

ADN por Erin Campbell

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Una aplicación relaciona los síntomas de las enfermedades raras con los genes que las provocan

Artículo publicado el 27 de febrero de 2013 en Fundación Descubre

Investigadores del Departamento de Biología Molecular y Bioquímica de la Universidad de Málaga han desarrollado una aplicación bioinformática para estudiar a gran escala las relaciones entre las enfermedades genéticas y los genes que las causan. Esta herramienta resulta de especial interés para las enfermedades denominadas raras, ya que en un alto porcentaje son de origen genético.

Bajo esta denominación se agrupan un conjunto de enfermedades heterogéneas (más de 6000), sobre las que se tiene un conocimiento incompleto. Cada una de ellas afecta a un número de personas muy reducido en el total de la población (menos de 5 personas entre 10 000) y plantean un desafío en términos de salud pública ante la falta de información sobre la que basar su diagnóstico, pronóstico y tratamiento. En Andalucía, globalmente se estima que hay más de medio millón de personas afectadas de alguna enfermedad rara, cifra que asciende aproximadamente a 3 millones en el total del estado español, según datos del grupo de investigación malagueño.

Sds uk supports Rare Disease Day

28 de febrero, Día de las Enfermedades Raras

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Los últimos neandertales del sur de Iberia no coexistieron con los humanos modernos

Artículo publicado por Laura Chaparro el 4 de febrero de 2013 en DivulgaUNED

El paso por el sur de Iberia de los últimos neandertales es más antiguo de lo que se pensaba y se remonta a hace unos 45 000 años y no 30 000, como se estimaba hasta ahora. Investigadores de la UNED han participado en la nueva datación de las muestras de dos yacimientos del centro y sur peninsular. Estos datos anulan la teoría de que sapiens y neandertales coexistieran en la Iberia del Pleistoceno superior.

En los últimos veinte años, la comunidad científica aceptaba la teoría de que los últimos neandertales –Homo neanderthalensis– seguían en el sur de Iberia en el momento en el que los humanos modernos –la especie Homo sapiens– se encontraban ocupando el norte de la península. Un estudio internacional, en el que participan investigadores de la UNED, desmonta esta hipótesis.

Miradas del Pasado

Miradas del pasado Crédito: Carlos Velayos

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Creado en miniatura el rayo tractor de Star Trek

Artículo publicado por Fiona McLeod el 25 de enero de 2013 en la Universidad de St. Andrews

Dentro del sistema experimental, el haz de luz se convierte en un dispositivo de arrastre, el cual reúne objetos microscópicos igual que cuando usamos una cadena.

Un equipo de científicos de Escocia y la República Checa ha creado un rayo tractor real, como el que aparece en las películas de Star Trek, que, por primera vez, permite que un haz de luz atraiga objetos.

Aunque las técnicas de manipulación de la luz han existido desde la década de 1970, esta es la primera vez que se ha usado un haz de luz para atraer objetos hacia la fuente luminosa, aunque sea a nivel microscópico.

Rayo tractor de Star Trek

Rayo tractor de Star Trek

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Descubierta la ‘cuádruple hélice’ de ADN en células humanas

Artículo publicado el 21 de enero de 2013 en SINC

Tras 60 años del descubrimiento de Watson y Crick sobre la estructura de doble hélice del ADN, investigadores de la Universidad de Cambridge han publicado un estudio que revela cómo las estructuras de cuatro hebras del ADN también existen en el genoma humano.

Quién les iba a decir en 1953 a James D. Watson y Francis Crick que su descubrimiento sobre la doble hélice del ADN, basado en el trabajo de Rosalind Franklin y galardonado con el premio Nobel, sería actualizado 60 años después.

Adn

ADN Crédito: Dasolvi

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Abundante vida en un lago antártico aislado bajo el hielo

Artículo publicado por Quirin Schiermeier el 26 de noviembre de 2012 en Nature News

El agua fría y salada del lago Vida ha dado lugar a la aparición de una gran cantidad de microorganismos.

Está cubierto de forma permanente por una espesa capa de hielo de 27 metros de grosor, es seis veces más salado que el agua marina habitual y con -13 ºC es uno de los hábitats acuáticos más fríos de la Tierra y, a pesar de ello, el lago Vida, en la Antártida, es un hervidero de vida.

Las perforaciones realizadas en el lago por los científicos desvelan abundancia y diversidad bacteriana. “El lago Vida no es un lugar fácil en el que sobrevivir”, afirma Peter Doran, experto en Ciencias de la Tierra de la Universidad de Illinois en Chicago y miembro del equipo que ha estado estudiando el lago (el más grande de una serie de acumulaciones de agua en la región de McMurdo Dry Valleys en el desierto Antártico). “Es muy llamativo que algo quiera vivir en un lugar tan frío, oscuro y salado”.

Doran y sus colaboradores han perforado dos veces el lago Vida: la primera en 2005 y de nuevo en 2010. La llamativa diversidad de vida microbiana que encontraron se presenta hoy en Proceedings of the National Academy of Sciencies.

Lago Vida © Crédito: Bernd Wagner, Universidad de Colonia, Alemania

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¿Las bacterias iniciaron la evolución de la vida multicelular?

Artículo publicado por Robert Sanders el 24 de octubre de 2012 en UC Berkeley

Casi siempre se acusa a las bacterias de ser agentes infecciosos, pero los científicos están descubriendo cada vez más beneficios, como mantener sanos nuestro intestino.

Un nuevo estudio sugiere ahora que las bacterias también podrían haber ayudado a iniciar uno de los eventos clave de la evolución: el salto de los organismos unicelulares a multicelulares, un desarrollo que finalmente llevó a los animales, incluyendo a los humanos.

Salpingoeca rosetta

Salpingoeca rosetta © Crédito: Nicole King

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Post Invitado: ¿Nos protege la dieta mediterránea?

El proyecto BioFilms está iniciado y mantenido por un grupo de estudiantes de la Universidad Pompeu Fabra de Barcelona, que se encuentran realizando un proyecto de una asignatura de máster para divulgar ciencia. Os presento en esta entrada el primer trabajo de su videoblog, en el que cada semana colgarán un vídeo sobre temas científicos de interés, dando un pequeño contexto y la opinión/visión de un experto en el tema.

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Vida que sobrevive en uranio

Artículo publicado el 30 de septiembre de 2012 en Astrobiology Magazine

La vida en los entornos extremos – por ejemplo en ácidos calientes o en metales pesados – puede, aparentemente, hacer que organismos similares lidien con el estrés de una forma muy distinta, de acuerdo con una nueva investigación de la Universidad Estatal de Carolina del Norte (NC State).

Los organismos unicelulares procedentes de un manantial termal cerca del Monte Vesubio en Italia, lucha directamente contra la toxicidad del uranio – se alimenta directamente del metal pesado y toma energía del mismo. Otro organismo unicelular que vive en una “pila ardiente” cerca de una mina de uranio abandonada en Alemania supera indirectamente la toxicidad del uranio – básicamente, cancelando sus procesos celulares para inducir un tipo de coma celular cuando hay niveles tóxicos de uranio en el entorno.

Bolas de uranio radiactivo © Crédito: dvanzuijlekom

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El ADN tiene una vida media de 521 años

Artículo publicado por Matt Kaplan el 10 de octubre de 2012 en Nature News

No puede recuperarse material genético de los dinosaurios, pero dura más de lo que se pensaba.

Pocos investigadores han dado crédito a las afirmaciones de que han sobrevivido muestras de ADN de dinosaurio hasta la actualidad, pero nadie sabía cuánto tiempo tardaba en desmembrarse el material genético. Ahora, un estudio realizado sobre fósiles encontrados en Nueva Zelanda, zanja la cuestión – y acaba con las esperanzas de clonar un Tyrannosaurus rex.

Parque Jurásico, un sueño imposible © by mastermaq

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La bacteria del arsénico prefiere el fósforo después de todo

Artículo publicado por Daniel Cressey el 3 de octubre de 2012 en Nature News

El transporte de proteínas muestra una preferencia 4000 veces mayor del fosfato sobre el arseniato.

Una bacteria que algunos científicos pensaron que podía usar arsénico en lugar de fósforo en su ADN, en realidad se desplaza largas distancias para acaparar cualquier traza de fósforo que pueda encontrar.

El hallazgo aclara una vieja pregunta surgida por un controvertido estudio1, publicado Science en 2010, el cual afirmaba que el microbio GFAJ-1 podía medrar en las condiciones de alta concentración de arsénico del Lago Mono en California sin metabolizar fósforo – un elemento esencial en todas las formas de vida.

Lago Mono © by kla4067

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Sólidas pruebas de que las partes del encéfalo evolucionaron independientemente

Artículo publicado por Morwenna Grills el 26 de septiembre de 2012 en la Universidad de Manchester

Un biólogo evolutivo de la Universidad de Manchester, trabajando junto a científicos de los Estados Unidos, ha encontrado sólidas pruebas de que las partes del encéfalo pueden evolucionar de manera independiente entre sí. Se espera que estos hallazgos avancen significativamente nuestra comprensión del cerebro.

El original estudio de 15 años de duración, llevado a cabo por investigadores de la Universidad de Tennessee y la Facultad de Medicina de Harvard, también ha identificado varios locus genéticos que controlan el tamaño de distintas partes del encéfalo.

Encéfalo © by Digital Shotgun

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Astronautas buscan vida bajo tierra

Artículo publicado el 27 de agosto de 2012 en ESA

Los astronautas sueñan con encontrar nuevas formas de vida y para un selecto grupo este sueño podría hacerse realidad esta semana (aunque en las profundidades de la Tierra en lugar de fuera, en el espacio exterior).

Un equipo internacional compuesto por seis astronautas iniciará unos entrenamientos en cuevas diseñados para preparar los vuelos espaciales.

“CAVES”, abreviación de Aventura Cooperativa para Evaluar y Ejercitar el comportamiento humano y las habilidades en el desempeño (en inglés, “Cooperative Adventure for Valuing and Exercising human behaviour and performance Skills”), prepara a los astronautas para trabajar con seguridad y eficacia y para resolver problemas como un equipo multicultural, mientras exploran áreas desconocidas utilizando protocolos espaciales.

Vida en la cueva

Vida en la cueva Crédito: ESA

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Un estudio sobre virus gigantes sacude el árbol de la vida

Artículo publicado por Diana Yates el 13 de septiembre de 2012 en la Universidad de Illinois

Un nuevo estudio sobre virus gigantes apoya la idea de que los virus son organismos vivos antiguos, y no remanentes moleculares inanimados y desbocados, como algunos científicos han defendido. El estudio puede cambiar la forma del árbol familiar universal, añadiendo una gran cuarta rama a las tres que la mayor parte de los científicos están de acuerdo que representan los dominios fundamentales de la vida.

Los nuevos hallazgos aparecen en la revista BMC Evolutionary Biology.

El árbol de la vida © by AJC1

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Físicos derivan las leyes de la termodinámica para la propia vida

Artículo publicado el 10 de septiembre de 2012 en The Physics ArXiv Blog

Las leyes de la termodinámica deben aplicarse a sistemas auto-replicantes. Ahora un físico ha calculado cómo.

Aquí hay un interesante experimento mental. Imagina una caja llena de distintos átomos y moléculas en proporciones aproximadamente equivalentes a la composición de la sopa prebiótica en la que medra la vida.

¿Qué probabilidad hay de que estas moléculas se reordenen en un ser vivo completo como una bacteria, por ejemplo? Esta es una pregunta difícil, pero Jeremy England del Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT) en Cambridge ha calculado una respuesta, al menos en teoría. Sus resultados son una fascinante lectura.

Primera ley  de la termodinámica © by vjbp56

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Se descubre una nueva fuente de metano entre la maleza

Artículo publicado el 5 de septiembre de 2012 en Max Planck

El gas de invernadero también es liberado por los hongos

Hace unos seis años tuvieron que actualizarse todos los libros de texto debido al sorprendente descubrimiento realizado por un grupo de investigación liderado por Frank Keppler sobre que las plantas producen metano en un entorno rico en oxígeno. En aquel momento era impensable, dado que era algo comúnmente aceptado que el metano biogénico solo podía formarse durante la descomposición del material orgánico bajo condiciones estrictamente anóxicas. Su grupo ha realizado ahora otra observación fascinante: los hongos producen metano.

Hongo de lluvia © by :::DaNka:::

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ENCODE: La enciclopedia humana

Artículo publicado por Brendan Maher el 5 de septiembre de 2012 en Nature News

Primero lo secuenciaron. Ahora han estudiado sus entresijos. Pero nadie sabe cuánta información contiene el genoma humano, o cuándo dejar de buscarla.

A Ewan Birney le gustaría imprimir todos los datos genómicos que él y sus colaboradores han recopilado a lo largo de los últimos cinco años como parte de ENCODE, la enciclopedia de elementos de ADN. Sin embargo, encontrar un lugar donde colocarlo sería un desafío. Incluso si contuviese 1000 pares de bases por centímetro cuadrado, la impresión se extendería a lo largo de 16 metros de alto y al menos 30 kilómetros de largo.

Genoma © by Rosa y Dani

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La restricción de calorías no ayuda a largo plazo

Artículo publicado por Amy Maxmen el 29 de agosto de 2012 en Nature News

La genética y la dieta sana tienen importancia para la longevidad.

Para aquellos que disfrutan de los placeres de la mesa, esta noticia puede suponer un alivio: recortar drásticamente las calorías no parece alargar el tiempo de vida en primates.

El veredicto, a partir de un estudio realizado a lo largo de 25 años en monos rhesus alimentados un 30% menos que los animales de control, representa otro golpe contra la idea de que un simple interruptor disparado por la dieta puede frenar el envejecimiento. En su lugar, los hallazgos publicados en el ejemplar de esta semana de Nature1, sugieren que la genética y la composición de la dieta tienen más importancia para la longevidad que el simple recuento de calorías.

Mono comiendo platano © by JesusAbizanda

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La vida extraterrestre quizá no lo es tanto – Si existe

Artículo publicado por Jason Major el 9 de mayo de 2012 en Universe Today

¿Somos demasiado optimistas en nuestra búsqueda de vida extraterrestre? A pesar del recuento de exoplanetas, super-Tierras y zonas de habitabilidad, la probabilidad de la existencia de vida en cualquier otro lugar del Universo se encuentra todavía en tela de juicio. Hasta la fecha, solo tenemos un ejemplo de la misma. Pero incluso si, de algún modo, existe vida en algún lugar fuera de la Tierra, ¿sería realmente tan diferente?

En un reciente estudio titulado “Bit by Bit: the Darwinian Basis for Life” (“Paso a Paso: la Base Darwiniana de la Vida”) de Gerald Joyce, Profesor de Biología Molecular y Bioquímica en el Instituto de Investigación Scripps en La Jolla (California), debate la naturaleza de la vida tal como la conocemos en relación a los bloques básicos que la constituyen, ADN y ARN,  y cómo su capacidad de transmitir información de su estructura permite separar la simple química de la verdadera biología.

Nebulosa con forma de ADN

Nebulosa con forma de ADN

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Récord de almacenamiento de datos en ADN

Artículo publicado por Monya Baker el 16 de agosto de 2012 en Nature News

Se codifica un libro completo con ilustraciones en ADN.

Un trío de investigadores ha codificado el borrador de un libro completo en ADN. El tomo de 5,27 megabits contiene 53,246 palabras, 11 imágenes JPG y un programa JavaScript, convirtiéndolo en el mayor conjunto de datos no biológicos jamás almacenado de esta forma.

El ADN tiene el potencial de almacenar ingentes cantidades de información. En teoría, se pueden incorporar dos bits de datos en cada nucleótido — la unidad básica de una cadena de ADN — por lo que cada gramo de molécula de doble hebra podría almacenar 455 exabytes de datos (1 exabyte corresponde a 1018bytes). Un empaquetado tan denso supera a los dispositivos inorgánicos de almacenamiento de datos como las memorias flash, discos duros o incluso el almacenamiento basado en métodos de computación cuántica.

ADN © by JohnGoode

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